左脳低形成によるてんかんは一般的に治癒は困難であるが、積極的かつ効果的な治療により管理することが可能である。
大脳形成不全によるてんかんは一般に治癒が困難であり、ほとんどの小児は若年で発症するため、フェニトインナトリウムやカルバマゼピンなどの従来の抗てんかん薬や、トピラマートやラモトリギンなどの新しい抗てんかん薬による長期治療が必要となる。
大脳形成不全によって誘発されるてんかんの多くは、一般に薬剤抵抗性てんかんであり、発作が長期化すると進行性の精神神経機能障害（変性）を引き起こす。
また、てんかんの種類にかかわらず、脳形成異常は危険であり、早期に治療する必要がある。