潰瘍生検の採取数は潰瘍の大きさや部位によって異なり、単発の場合は1～6個、多発の場合は部位の数によって異なる。 潰瘍生検は一般的に潰瘍の病変部位を確認し、組織を数片採取し、顕微鏡で染色して病理学的、免疫学的検査を行うが、生検の前に最も重要なことは組織を採取することである。 潰瘍が単発の場合、一般に小さな潰瘍であれば、1〜2片の組織を採取することができるが、潰瘍が大きい場合は、検査のために2〜4片の組織を採取する必要があり、潰瘍が悪性であると疑われる場合は、複数の部位で5〜6片の組織を採取する必要があり、その場合の精度は高くなる。 多発性潰瘍の場合は、複数の潰瘍面を選んで採取する必要があり、5～6片、あるいはそれ以上の採取が必要になることもある。 組織採取は常に医療専門家の監督下で行うべきである。