先天性巨大結腸症には.全結腸型.長大結腸型.普通結腸型.短小結腸型など多くのタイプがある。 神経細胞の欠損の長さによって.臨床症状も異なり.治療方法も異なります。 全結腸型巨大結腸症の治療効果は非常に低く.比較的良い方法はなく.一般的に言えば.早期には瘻孔を形成し.マーチン手術などの特殊な手術を行う必要があります。 S状結腸ガングリオン全体が欠落しているような長節型であれば.比較的長いこの種の大腸の異常は.手術は一般的に瘻孔を解決することができるように.子供が正常な栄養発達をすることができるように.あまりにも栄養不足になることはできません.第二段階は.大腸の手術の吻合時に行うことができます。 短区間型や一般的なタイプであれば.腹腔鏡手術など低侵襲で異常腸管を単純切除し.再吻合することで治療できるようになりました。 短区間型や肛門狭窄の局所拡張型であれば.肛門拡張術を行った後.長期間の拡張が徐々に緩和されることもある。 従って.このような手術は一般的に重症度に基づいて行われ.重症の場合はまず瘻孔を形成し.比較的軽症の場合は直接吻合する第一段階の手術が行われます。