胎児心室中隔欠損症の自己治癒率は約30～50％である。 胎児心室中隔欠損症が発生したら、通常は最初は神経質にならず、状態を注意深く観察する方がよい。 胎児期は心臓がまだ発達しているため、患者によっては出生後に心室中隔欠損症が自力で閉鎖することもあります。 出生後に心室中隔欠損症が閉鎖せず、まだ残っている場合でも、時間が経てば自力で閉鎖し直すことができる患者もいます。 全体的に、心室中隔欠損が小さい患者は自己治癒率が高く、欠損が大きい患者は自己治癒率が低い。 一般的に5mm以下の欠損の自己治癒率は約50％で、ほとんどが1年以内に治癒する。 もちろん、欠損が1年以上経っても治癒しない場合は、再び治癒する可能性はほとんどありません。 子供が心室中隔欠損症になった場合は、子供を注意深く観察し、異常があれば医師の診察を受けることが重要です。