新生児の消化管奇形の治療は、発症部位に応じて外科的に行われる。 また、奇形の程度によって適切な治療計画を立てる。 新生児の胃腸奇形は、腸管の病変部位が腸閉塞症状であれば、適時外科的治療が必要である。新生児に電解質異常が出現した場合は、電解質異常と酸塩基平衡の不均衡を是正する必要があり、十二指腸吻合術などの外科的治療によって医師の指示に従い、安定させる。 新生児に重篤な合併症を引き起こさないためにも、新生児消化管奇形の治療が早ければ早いほど良い結果が得られ、できるだけ早く栄養の消化吸収を回復させ、新生児の正常な成長と発育を促すことができます。 新生児胃腸奇形は、親が新生児を時間内に病院に連れてきて、医師の指示に従って積極的に治療する必要がある。