小児の扁桃結石は一般治療、薬物治療、手術治療により、症状を改善し、病状をコントロールすることができます。
1、一般治療：小児の扁桃結石は主に扁桃上陰窩に発生し、長期に閉塞し、分泌液の排出がスムーズでないため、カゼ状物質が溜まって結石となる。 小児の扁桃結石は、まず、うがいを強化し、しばしば塩水などでうがいをし、うがいによって小石をきれいに取り除くことができます。
2.薬物療法：小児の扁桃結石は慢性扁桃炎と関連していることが多いので、免疫療法や抗アレルギー療法を行うことができます。例えば、減感作細菌製剤（溶連菌アレルゲンやワクチンによる減感作など）の使用や、プラセンタグロブリン、移行因子などの各種免疫増強剤の注射などを行い、慢性扁桃炎を治療し、扁桃結石の発生を抑えます。
3.外科的治療：結石が小さければ、ヘラやペンチで摘出するか、陰圧吸引で個別に摘出する。 さらに結石を取るのが困難な場合は、扁桃腺も一緒に完全に切除して完治を目指す手術が必要です。
小児に扁桃結石が発生した場合は、適時に病院を受診させ、医師の指示に従って投薬や治療を調節する必要がある。 同時に、十分な睡眠と適度な運動を心がけ、体の抵抗力を高める必要がある。