慢性咽頭炎の治療はその臨床分類によって異なり、慢性咽頭炎の治療は主に原因治療と対症療法からなるが、具体的な効能は人によって異なり、どれが一番良いとは言えない。
1.慢性咽頭炎：主に単純型、肥厚型、萎縮型、乾燥型の3つに分けられる。
(1)慢性単純性咽頭炎：うがい薬（ホウ砂配合液など）、錠剤（ヨウ素剤など）、その他の薬物治療が一般的。
(2)慢性肥厚性咽頭炎：一般的に使用される①薬物療法：上記のうがい薬や錠剤のほか、リンパ濾胞過形成の場合、濾胞に薬剤（硝酸銀液など）を使用して焼灼する必要があります。
(3)萎縮性咽頭炎と乾燥性咽頭炎：ヨードグリセリン、ビタミン剤（ビタミンA、ビタミンCなど）、その他の薬物療法が一般的です。
2.慢性喉頭炎：対症療法と原因療法に分けられる。
(1)対症療法：①一般治療：声を小さくする、禁煙、禁酒など、②薬物療法：一般的に使用される副腎皮質ステロイド薬（プレドニンなど）、鎮痛薬（イブプロフェンなど）、抗感染薬（アモキシシリンなど）など、症状に応じて選択する必要がある。
(2)原因治療：慢性喉頭炎は胃食道逆流症、甲状腺機能低下症などの原疾患がある可能性があり、診断された場合は、胃酸を抑えて胃に栄養を与え、サイロキシン錠剤を服用するなど、的を絞った治療を行う必要がある。
しかし、上記の治療の効果には個人差があり、すべての患者に有効ないわゆる「最良の治療法」は存在しないことに注意が必要である。 個別の治療計画は医師の指導のもとに立てるべきであり、有害な結果を避けるためにやみくもに用いるべきではない。