イエネコの治療に処方箋はなく、イエネコは生理的なイエネコと病的なイエネコに分けられ、生理的なイエネコに対しては主に一般的な治療を行う。 病的なイエネコに対しては、薬物治療と外科治療が行われる。
1.一般的な治療：生理的なイエネコに対しては、視力に影響を与えないので、一般的に特別な治療を必要としない。
2.薬物治療：感染症など他の病的要因がある場合、レボフロキサシン点眼薬、エリスロマイシン眼軟膏などを使用して感染症を抑えることができる。 眼内出血が生じた場合は、p-アミノメチル安息香酸やフェノールスルホニルエチルアミンなどの薬剤で眼内出血を抑制する。
3.手術：特に重症のアフタ性蚊症では、薬物療法で効果が不十分な場合、硝子体手術やレーザー硝子体焼灼術などの手術療法も考慮する。
現在のところ、アフタ性蚊症の治療に関する処方箋はないため、アフタ性蚊症の患者さんは時間内に病院を受診し、病気の原因に応じて適切な治療を受けることをお勧めします。