新生児脳嚢胞は個人差があるため、自己回復の可能性もそれぞれ異なる。
新生児嚢胞は先天性の良性空間占拠性病変で、主に脳脊髄液が長期間脳管膜に取り囲まれたために嚢胞構造が出現し、この種の嚢胞を持つ新生児のほとんどは徐々に吸収されますが、時間がかかります；ごく一部の嚢胞は自力では吸収されず、外科的治療を受ける必要があります。
脳の嚢胞は成長し続けると、脳の神経を圧迫して頭痛やめまいなどの症状を引き起こすことがあるので、脳の嚢胞を発見した新生児は時間内に病院に行って関連検査を受け、医師と協力して積極的な治療を行う必要がある。