慢性咳嗽の原因はさまざまであり、咳嗽症状を効果的に緩和するためには、原因に合わせた治療が必要である。 慢性咳嗽の原因が喘息や咳変形性喘息などであれば、ネブライザーが有効である。 しかし、胃食道逆流症（GERD）など他の原因による場合は、ネブライゼーションは有用ではなく、咳の原因に対処する必要がある。
慢性の咳は8週間以上続く咳と定義され、喘息、咳変型喘息、胃食道逆流症、点鼻後症候群など様々な病気が原因となる。 喘息、咳変型喘息による咳であれば、ブデソニドなどのグルココルチコステロイドやテルブタリンなどのβ作動薬の使用が咳症状の緩和に有効である。
胃食道逆流症（GERD）など他の原因による場合は、通常、ネブライゼーションは有効ではなく、原因に対処する必要がある。 例えば、GERDの場合、咳の症状を緩和するにはオメプラゾールなどのプロトンポンプ阻害薬が必要である。
慢性咳嗽患者は、定期的に病院に行って診察を受け、具体的な原因を明らかにし、原因に応じて適切な治療方法を選択すべきである。 同時に、慢性咳嗽患者は日常生活で良い食生活を維持する必要がある。