肛門けいれんの原因としては.1.肛門周囲の感染症.特に肛門裂部上の高位膿瘍が.骨盤腔底部の周囲の神経組織を占拠して拡大することによって起こる。 2.骨盤腔底部の腫瘤や直腸後部腔の前仙骨腫瘍.嚢胞.骨盤底ヘルニア。 3.直腸やS状結腸下部に起こる炎症性疾患.例えば潰瘍性大腸炎が腸粘膜に炎症を起こして腸壁に浮遊刺激を与えて起こる。 4。 4.直腸腫瘍：腸管腔内で成長する腫瘍の閉塞と直腸周囲組織への浸潤が原因 5.骨盤底弛緩.痙攣.変性変化による骨盤底臓器脱や骨盤底下垂.また出口閉塞型便秘の一部の患者にはしばしば下行症状が見られる。