子供の便秘は、ラクツロースやプロバイオティクスの経口投与で調整でき、食事構成や運動も治療に用いられる。 また、便秘の誘発因子に応じて、的を絞った治療を行います。 最も一般的に使用される便秘治療薬はラクツロースで、ラクツロースは下剤ですが、プロバイオティクス（乳酸菌錠など）で腸内細菌叢のアンバランスを調整することで、規則正しい排便を維持し、便秘を解消することができます。 同時に、排便を促す運動や水分摂取を心がけましょう。 便秘が改善しない場合は、腸管超音波検査を行って先天性巨大結腸を除外する必要があります。 しかし、保存的治療がうまくいかなかったり、病状が重篤であったり、根治的手術の条件が整わない場合は、人工肛門を造設します。 先天性巨大結腸症に対しては、根治的手術を行うのが最善です。 上記の薬はすべて、医師の管理下で服用する必要があります。