嚢胞が小さければ経過観察でよいが、大きかったり神経を圧迫している場合は手術で摘出する。 脊髄嚢胞が比較的小さく、画像診断で明らかな症状が出ない場合は、定期的な経過観察とともに、症状の継続的な観察が中心となり、保存的治療で嚢胞をコントロールできる特効薬はありません。 しかし、嚢胞自体が大きかったり、神経を圧迫して痛みやしびれなどの症状がある場合は、手術に対する明確な禁忌がない限り、適時に外科的切除を行うことが脊髄嚢胞の基本的な治療法である。 該当する患者には、医師の診察を受け、的を絞った治療と治療を受けることを勧める。