骨髄移植と造血幹細胞移植の違いは、骨髄移植が造血幹細胞移植の一種であるのに対して、造血幹細胞移植はより広い応用範囲を持つことである。
1.骨髄移植：健康な人から採取した骨髄を患者の体内に移植することで、患者が正常な造血機能と免疫機能を回復するのを助ける。 通常、白血病、再生不良性貧血、サラセミア、骨髄異形成症候群などの血液疾患の治療に用いられる。
2.造血幹細胞移植：全身照射、化学療法、免疫抑制療法（ロイコボリン、フルダラビンなど）を受けた患者さんの体内に、自己造血細胞または正常ドナーの末梢血造血幹細胞を注入し、病気の治癒を目指す方法です。
造血幹細胞の供給源によって、現在、骨髄移植、臍帯血幹細胞移植、末梢血幹細胞移植の3種類がある。 したがって、骨髄移植は造血幹細胞移植の一種であり、造血幹細胞移植はより広い応用範囲を持つ。