小児のネフローゼ症候群の予後は、病気の種類と原因によって判断する必要があり、症状の軽いものは一般に治癒可能であるが、複雑なものは治癒が容易ではない。 一次性急性ネフローゼ症候群の場合、多くは感染症が原因であり、病状は単純で、原因も除去しやすく、軽微な微小病変と軽度の腹膜過形成があれば、適時の治療で治すことができる。 しかし、一部の二次性ネフローゼ症候群では、そのほとんどが糖尿病性腎症、アレルギー性紫斑病性腎炎などの基礎疾患を伴っており、さらに一部の小児では先天性の遺伝的欠陥があるため、治療が難しく、病気の原因を取り除くことが容易ではなく、根絶率は非常に低い。 もし子供たちがネフローゼ症候群と診断されたら、積極的に医師と協力して治療を受けるべきであり、積極的な治療によって治癒率を向上させることができる。