先天性喉頭喘鳴が自然に治るかどうかは、その原因や症状の程度によるので、一概には言えない。 喉頭軟骨形成不全によるもので、症状が軽ければ自然に治ることもあるが、他の原因によるものであれば、通常は自然には治らない。 先天性喉頭斜頸は、出生後の乳幼児にみられる吸気性喉頭斜頸で、喉頭閉塞の症状であり、重症例では三重陥凹徴候（吸気時の胸骨上窩、鎖骨上窩、声門下陥凹）を伴うことがあるが、その多くは先天性喉頭軟骨軟化症によるもので、先天性喉頭ウェービング、先天性喉頭嚢胞、先天性喉頭裂などが原因となることもある。 喉頭軟骨の発育不全による先天性喉頭喘鳴の場合、症状が軽く、呼吸困難が明らかでない場合は、あわてて対処する必要はなく、まず状態をよく観察し、十分で合理的な栄養を与え、2歳くらいまで徐々に発育・成長するのを待つと、症状は自然に治ります。 しかし、呼吸困難などの症状が重い場合は、自然治癒は難しいので、医師の治療が必要です。 先天性喉頭喘鳴の他の原因、例えば先天性喉頭ウェビング、先天性喉頭嚢胞、先天性喉頭裂などは、通常、症状がより重く、子どもの生活の質に影響を及ぼし、自然治癒することはありません。 先天性喉頭喘鳴のある子供は、病気の原因を特定するために、速やかに医師の診察を受けるべきであり、両親は日常生活における子供のケアにもっと注意を払うべきである。