新生児心不全、すなわち先天性心疾患の原因は、遺伝的要因、物理的要因、化学的要因、生物学的要因、母体の妊娠要因の組み合わせである。 1.遺伝的要因：両親が先天性心疾患であれば、子供の先天性心疾患の確率は高くなる。 2.物理的要因：電磁波を含む大気汚染は、新生児の先天性心疾患の有病率を増加させる。 3.化学的要因：重金属や農薬の摂取も発症率を高める。 4.生物学的要因：妊娠初期または中期にサイトメガロウイルス、風疹ウイルス、ヘルペス、単純ヘルペスウイルスに感染した母親は、小児の先天性心疾患の有病率を増加させる。 5.妊娠障害：高血圧、妊娠糖尿病、母体の甲状腺機能低下症や甲状腺機能亢進症などがあり、これらも先天性心疾患の重要な原因である。 心臓が閉鎖していない新生児には、積極的な介入や医師による経過観察が必要である。