低位瘻孔と高位瘻孔は、解剖学的部位、排液の特徴、重症度などによって区別できる。
1.解剖学的部位：解剖学的部位は、低位瘻孔と高位瘻孔を区別する主なポイントである。 肛門瘻を例にとると、瘻孔が肛門括約筋より深い位置にある場合は高位肛門瘻、瘻孔が肛門括約筋より深い位置にある場合は低位肛門瘻となる。
2.排液の特徴：低瘻孔と高瘻孔の排液の特徴にも大きな違いがある。 腸瘻を例にとると、高位腸瘻の排液には刺激性の消化液が多く含まれ、腹膜刺激症状がより強い。低位腸瘻の排液には代謝性老廃物が含まれ、刺激性物質が少ないため、刺激症状は比較的軽い。
3.重症度：低位瘻孔と高位瘻孔の重症度にも大きな差がある。 腸瘻を例にとると、腸瘻が多いと消化液が大量に失われ、水電解質酸塩基平衡に重大な障害が起こる可能性があり、そのリスクは比較的高く、腸瘻が少ないとそのリスクは比較的低い。
瘻孔が疑われる患者は、適時に通常の医療機関を受診し、関連する診断と治療に積極的に協力し、病状を遅らせることを避けるべきである。