肺炎マイコプラズマ陽性の小児では、主に感染症治療が行われ、重症例では状態に応じてグルココルチコイドや気管支鏡検査が追加されることもある。
1.抗肺炎マイコプラズマ治療：マクロライド系が望ましく、小児ではアジスロマイシンが一般的である。 一部の薬剤耐性マイコプラズマについては、特定の問題を分析する必要がある。 特定の薬剤は、長所と短所を考慮した上で、医師の指導のもとに使用すべきである。
2.グルココルチコステロイド：グルココルチコステロイドは普通の小児にはルーチンに使用されないが、急性発症、急速な発育、重症の小児には考慮される。
3.ガンマグロブリン：中枢神経症状、免疫性溶血性貧血、その他の自己免疫疾患を合併している場合、医師の指導のもとでガンマグロブリンの使用が考慮される。
4.小児軟性気管支鏡検査：気管支鏡洗浄が呼吸閉塞の適時緩和と肺内炎症反応の軽減に重要である。
同じ疾患であっても、身体状態や病期、治療法が異なる患者に対しては、医師の指導のもと、適時、標準的な治療を行う必要がある。