よもぎ水足浴には、経絡を温め、寒を散らし（人の経絡を温め、体内の寒を散らす）、湿を取り、かゆみを和らげる効果がある。 ただし、効果は限定的であるため、期待する効果を得たい場合は、医師の指導のもと、定期的な施術を行うことをお勧めする。
よもぎは、よもぎの葉と呼ばれる葉を薬として利用できる植物である。 よもぎには、経絡を温めて止血する作用（人体の経絡を温めて体内の出血を止める）、寒を散らして痛みを和らげる作用（体内の寒を散らして痛みを和らげる）、湿を散らしてかゆみを和らげる作用があります。 吐血、漏血（月経過多や垂れ流し）、湿疹、疥癬、痔核、癰潰瘍などの主な治療薬である。
ヨモギ水に足を浸した後、不快感がある場合は使用を中止し、速やかに医師の治療を受けることをお勧めする。