ラクナ虚血病巣の重症度は、病巣の大きさと位置に関係する。 単発の小さな虚血病巣は重篤ではないが、重要な部位に多発するラクナ虚血病巣は重篤である。
散発性虚血巣は比較的小さな病巣であり、通常は重篤な臨床症状を示さず、比較的軽度である。特に孤立性虚血巣の場合、患者は通常臨床症状を示さず、病巣の存在は画像検査中にしか検出できない。
海綿状虚血巣が多発し、脳幹などの重要な部位に存在する患者では、重症度が著しく上昇し、頭痛やめまいを引き起こし、重症例では神経学的欠損を生じることさえある。
ラクナ虚血巣を有する患者は、医師の指導のもとに重症度を評価し、患者に関連しうる危険因子を把握し、大規模な脳梗塞の発生を予防するために必要な場合には適時治療を行う必要がある。