アルカリフォスファターゼが正常であっても肝癌を否定することはできず、肝癌の診断はアルカリフォスファターゼの値に左右されるものではない。 血清アルカリホスファターゼは主に肝臓と骨に由来し、アルカリホスファターゼの上昇は胆道閉塞、肝炎、肝硬変、線維性骨疾患の患者によくみられる。 アルカリホスファターゼは、肝細胞がん患者では正常または上昇することがある。 したがって、アルカリホスファターゼを肝細胞がんの診断指標として用いることはできず、アルカリホスファターゼが正常でも肝細胞がんを除外することはできない。 肝がんの診断には、病歴、α-フェト蛋白、超音波検査、CTなどの画像検査が必要である。 α-フェトプロテインの異常上昇は、肝癌の特異的腫瘍マーカーであり、α-フェトプロテインの異常上昇と超音波検査、CT検査、その他の画像検査とを併用して、血液供給が豊富な肝臓の空間占拠性病変を検出すれば、肝癌の診断に役立つ。 アルカリフォスファターゼが正常であっても肝細胞癌を除外することはできないので、患者は肝細胞癌かどうかをはっきりさせるために、関連する検査を改善するために間に合うように病院に行くべきである。