高リポ蛋白Aは、動脈硬化、急性心筋梗塞、家族性高コレステロール血症、先天性高リポ蛋白血症、糖尿病、大動脈瘤、体内のいくつかの癌の存在を考慮し、多くの心血管疾患の独立した危険因子である。 1.アテローム性動脈硬化症：アテローム性動脈硬化症は様々な因子によって引き起こされ、その病態は複雑で、まだ完全には解明されていない。 主な危険因子としては、高血圧、高脂血症、喫煙のほか、糖尿病、肥満、遺伝的因子などが挙げられる。 2.急性心筋梗塞：ほとんどの患者は冠動脈のアテローム性動脈硬化性狭窄に基づいて発症する。 ある原因因子のために冠動脈のアテローム性動脈硬化プラークが破裂し、血液中の血小板が破裂したプラークの表面に蓄積して血栓を形成し、これが突然冠動脈の内腔を塞いで心筋虚血と壊死を引き起こす。 3.家族性高コレステロール血症：家族性高コレステロール血症は常染色体優性遺伝の稀な疾患であり、家族性を示す。 患者は低比重リポ蛋白（LDL）コレステロール値が異常に高い。 高LDL-Aは先天性高リポ蛋白血症、糖尿病、大動脈瘤、一部の癌などでもみられる。