先天性巨大結腸は通常、自然治癒しない。
先天性巨大結腸は一般的な先天奇形で、通常は自然治癒は望めない。 診断が確定し、手術に耐えられる患者に対しては、便秘、大腸炎、腸閉塞、腸穿孔などの重篤な結果を避けるため、手術は期限内に行う必要がある。
先天性巨大結腸は、腸管神経細胞の欠乏により、腸管が痙縮して狭窄し、蠕動障害が起こり、腸内容物を排出できずに腸管内に蓄積し、その結果、病変の近位端で腸管が著しく拡張し、次第に巨大結腸を形成するため、診断が確定したら、できるだけ早く手術を行う必要があり、当院では根治手術や腸瘻造設術を行うことが多い。
もし先天性巨大結腸と診断されたら、病状を遅らせることのないよう、適時に通常の病院へ行き、標準的な治療を受けることを勧める。