12歳の男の子の顔が暗くて黄色いのは、貧血、肝機能の病気、栄養のアンバランスなどが原因かもしれない：
1.貧血：男の子の顔が暗くて黄色い状態が長く続き、食欲不振や憂鬱感を伴う場合、貧血が原因である可能性がある。
2.肝機能疾患：上記のような症状がある場合、B型慢性肝炎、C型慢性肝炎、肝膿瘍、原発性肝細胞がんなどの肝機能疾患が関係している可能性がある。
3.栄養のアンバランス：普段から偏った食事や偏食の習慣がある少年は、栄養のアンバランスを引き起こし、顔が黒く黄色くなることがある。
12歳の男の子の顔が黒く黄色いのは、他の病気も関係している可能性があるので、早めに病院に行って関連する検査を受け、病気の原因をはっきりさせ、積極的に対症療法を行うことをお勧めします。