性交後の陰茎の根元の痛みは、局部の圧力、感染、尿道結石、前立腺炎などの原因が考えられます。
1.局部圧力：陰茎が太くて、膣がきつくて、動きが激しくて、姿勢が異常な要因で、陰茎が膣に衝撃と圧力を受けて、陰茎の根元がうっ血して、このような症状が出ます。
2.感染症：男女の会陰部がきちんと清潔でなく、衛生的でなく、性交の環境が汚く、頻繁に性交し、女性自身が性感染症などの要因で性交し、細菌、ウイルス、梅毒スピロヘータなどの病原体が尿道を通して逆行性感染し、尿道炎、尿道水腫、うっ血などの症状を引き起こします。
3.尿道結石：男性の尿道膜に結石が形成されると、性交の過程で膣壁の摩擦によって陰茎の根元が圧迫され、尿道内の結石と尿道粘膜が接触して陰茎の根元が痛む。
4.前立腺炎：前立腺炎患者が同じ部屋にいると、腹部の衝撃が直接前立腺を刺激し、一方では、前立腺から前立腺液が大量に分泌され、上記の過程が前立腺の炎症反応を悪化させるため、症状が出る。
性交後の陰茎の付け根の痛みは、様々な要因が関係している可能性がありますので、明確な診断のために医師に相談することをお勧めします。