オカルト陰茎：下腹部壁の筋筋膜層と陰茎本体の付着異常による先天性の発育異常で.陰茎が外側に伸びるように陰茎を縛っているため.陰茎の皮膚がうまく発育せず.陰茎本体への付着も異常で.エンコプレシーが解消できず.陰茎が短く円錐形の外見になる。 手術が必要で.手術治療の最適な時期は3～5歳です。 埋没陰茎：陰茎の外見の後天的な異常で.肥満と厚い恥骨前脂肪パッドのために陰茎の露出が悪くなることが原因です。 手術による治療は不可能である。 最良の治療法は減量です。 陰茎陰茎癒合症：陰茎陰茎癒合症とも呼ばれ.陰嚢中縫合部の皮膚が陰茎の腹側の皮膚と癒合し.陰茎が陰嚢から不完全に分離した状態になる先天性の疾患です。 瘢痕陰茎：これは.包皮の瘢痕が形成されるほどの度重なる炎症.外傷.不適切な手術によるもので.亀頭の露出に影響を及ぼす。 重症の場合.排尿や陰茎の勃起に影響を及ぼすこともある。 外科的治療が必要である。 小陰茎：陰茎の描出長さ（SPL）が同年齢の陰茎の描出長さの平均の標準偏差（SD）の2.5未満であり.染色体が46XYであり.陰茎周囲の長さと長さの比が正常であり.他の陰茎奇形（例えば.低空羂索症）がない先天性の発育異常。 米国での有病率は1.5/10,000であり.わが国での有病率はまだ不明である。 内分泌異常によって.小陰茎は大きく3つに分類されます。低ゴナドトロピン性性腺機能低下症（下垂体・視床下部機能不全）＋高ゴナドトロピン性腺機能低下症（一次性精巣機能不全）＋特発性腺機能低下症（視床下部-下垂体-精巣軸の機能が正常）であり.複雑な治療法があります。