エイズ治療薬を服用しても、エイズのウインドウ・ピリオドには影響しない。ウインドウ・ピリオドは基本的に普通の人と同じで、3週間から6ヶ月である。 というのも、AIDSのウィンドウピリオドとは、AIDSに感染しているが臨床的に発見できない期間を指すからである。 たとえ経口HIV遮断薬に感染の危険性が残っていても、そのような患者にはまだウインドウピリオドがあり、検出方法が比較的遅れていれば、潜伏期間が約半年に達するものさえある。 しかし、今科学技術の発展に伴い、検出方法の開発は3世代、4世代の検出方法が登場し、ウィンドウ期間の範囲を大幅に短縮し、もし4世代の検査陰性3週間を除外することができます。 したがって、経口HIV遮断薬を服用した後、1ヶ月、3ヶ月、あるいは半年に1回HIV抗体を検査することをお勧めします。