副鼻腔炎の最良の治療法は、副鼻腔炎の罹患期間（副鼻腔炎は罹患期間によって急性副鼻腔炎と慢性副鼻腔炎に分類される）と具体的な症状を考慮して、個々に最も適切な治療方針を決定することです。 一般的には薬物による保存的治療が行われますが、炎症の程度が重く、保存的治療が無効な場合は外科的治療も考慮されます。
1.急性副鼻腔炎：全身治療（セファロスポリン系抗生物質、ペニシリン系抗生物質による感染抑制など）、副鼻腔排膿改善（エフェドリン点滴）、上顎洞穿刺灌流、副鼻腔補充療法、病因治療、粘液排膿促進剤治療、ホルモン療法。 ほとんどの症例は保存的治療で治癒する。
2.慢性副鼻腔炎：抗生物質（マクロライド系など）、血管収縮薬、粘液排出促進薬、抗ヒスタミン薬、高張食塩水、理学療法（超短波温熱療法など）、副鼻腔置換術。 副鼻腔炎の罹患期間が長く、症状が重篤で、保存的治療が無効で、鼻中隔彎曲症や鼻ポリープを合併している場合は、手術が考慮されます。
副鼻腔炎を患っている場合は、通常の病院で診察を受け、症状に応じて個別の治療計画を立てることをお勧めします。