二次感染とは、病原微生物に感染したり、ある病気に罹患したりした患者が、不合理な治療や免疫力の低下など様々な原因により、新たな病原体に感染したり、もともと体内に潜伏していた病原体が復活したりすることにより、感染症が出現することである。
二次感染に至る原因はいろいろありますが、最も多いのは抗生物質の長期間の不適切な使用で、例えば肺炎患者の抗生物質の点滴が長すぎたり、強すぎる抗生物質治療を選択したりすると、腸内細菌叢のバランスが崩れ、病原性のある細菌が消化管内に非病原性潜伏し、患者は腹痛、下痢、吐き気、嘔吐などの消化器症状を起こすことがあります。
二次感染の原因は、もともとの細菌感染症に見られることもあり、治療後、真菌感染症などの他の種類の病原体に再感染し、特に抗生物質の不適切な使用や抗生物質の長期使用では、真菌感染症を誘発しやすくなります。 二次感染は、慢性腎臓病や糖尿病などの基礎疾患を持つ患者に多くみられる。
二次感染は二次性腹膜炎でもみられることがあり、これは通常、腹腔内の臓器の炎症、破裂、穿孔、腹部外傷、手術などによって、大量の消化液や細菌が腹腔内に侵入したことによる二次的な急性炎症状態である。
二次感染症は、遅れないように医師の指導の下、速やかに治療する必要がある。