巣状分節性糸球体硬化症の小児が末期腎不全に陥るまでの期間は、主に病型や治療効果などの要因に依存する。 崩壊型は治療効果が乏しく、進行が早いため、2年以内に末期腎不全に移行することが多い。 巣状分節性糸球体硬化症は一次性ネフローゼ症候群で、青年に多く小児には少なく、顕微鏡的病変腎症（小児に多い）から移行するものもある。 先端型の多くはグルココルチコイド療法が有効で、予後は良好で、末期腎不全に移行する時期には個人差がある。 崩壊型巣状分節性糸球体硬化症の場合、治療効果が乏しく進行が早いため、ほとんどが2年以内に末期腎不全に入る。他のタイプの治療が無効な患者の半数以上は、6～10年で末期腎不全に入る可能性がある。 もし小児に巣状分節性糸球体硬化症が発見された場合は、通常の病院を受診し、医師の指導のもと標準的な治療を受けることをお勧めする。