トランス脂肪酸の代謝は一般的な脂肪酸の代謝と同じで、合成脂肪や酸化的エネルギー供給といった代謝経路がある。 1.合成脂肪：トランス脂肪酸は吸収された後、腸や肝細胞、血液中で中性脂肪と反応してトリグリセリド、すなわち脂肪を合成し、血液中の低比重リポ蛋白（LDL）濃度を高めて高脂血症を引き起こす。 さらに、体内でのコレステロールの合成を促進し、長期的には動脈硬化を引き起こす。 2.酸化的エネルギー供給：トランス脂肪酸はβ酸化によって活性化され、エネルギー供給に利用される。 しかし、この過程は心臓血管系にダメージを与えるため、トランス脂肪酸をエネルギー供給物質として使用することは推奨されない。 心臓血管系にダメージを与えるだけでなく、TFAは体内のコレステロールの産生を促進し、血中脂質が急激に上昇して血管硬化を引き起こす。 トランス脂肪酸を含む食品を長期間摂取すると、高血圧、糖尿病、その他の慢性疾患を引き起こしやすくなる。 薄味の食事を心がけ、高脂血症が発見された場合は、病院を受診し、医師の指導のもと、適時に脂質低下治療を受けることをお勧めする。