安宮牛黄丸の服用は腎不全には勧められないし、安宮牛黄丸に含まれる一部の生薬は肝臓と腎臓に水銀中毒のリスクを高める。
安宮牛黄丸には朱砂、アンドログラフィスなどの生薬が含まれており、完成品には水銀、硫化ヒ素などの重金属無機塩化合物が含まれているため、水銀中毒などの発生を避けるために、患者は安宮牛黄丸を長期間服用しないほうがよく、特に肝腎機能が低下している患者や高齢者は服用しないほうがよい。
安宮牛黄丸は清熱解毒、怯え抑制、精神開放の作用があり、発熱、心膜邪、高熱痙攣、せん妄（振戦せん妄、譫妄）；脳卒中昏睡及び脳炎、髄膜炎、中毒性脳症、脳出血、敗血症の治療に用いることができ、上記の症状を参照してください。
薬の副作用と禁忌は明確ではありません、妊娠中の女性やスポーツ選手は注意して使用する必要があります、特定の薬の使用は、専門の医師の指導の下でお勧めします。