慢性裂肛は通常、外科的介入によってのみ治癒可能である。 急性裂肛に対する非外科的治療が無効な場合、または裂肛が8週間以上経過して慢性裂肛を形成している場合は、通常、外科的介入が必要となる。 最も一般的に使用される手術は、裂肛を治すために内括約筋の一部を切断して痙攣を緩和または除去する内括約筋部分切除術ですが、この手術には肛門失禁のリスクがあります。 さらに、裂肛切除術、すなわち前痔核、肥大した肛門乳頭、潰瘍化した裂肛をすべて外科的に切除して新鮮な創を形成し、創の治癒を促進するために温水座浴を併用する方法がある。裂肛が比較的大きい場合は、肛門管周囲の皮膚のフラップ移植を行うこともできる。 慢性裂肛の患者は、医師の指示に従い、治療を調整すると同時に、食物繊維を含む野菜や果物を多く摂ることが推奨される。食物繊維は、病状をコントロールし、治療効果を維持し、病気の回復を促進する役割を果たす。