スクランブルエッグの栄養価は比較的豊富で、他の調理法の卵と同様、動物性タンパク質、レシチン、ビタミン、ミネラルが豊富に含まれており、体に吸収されやすい。 卵は、動物性タンパク質、カルシウム、ビタミン、多くのミネラルを豊富に含むだけでなく、レシチンやコレステロールを含み、その栄養価の高さが認められている。 1日に1～2個の卵を食べることで、体に必要な栄養を満たすことができる。 卵100グラム当たりのカロリーは144キロカロリーで、そのうちタンパク質は3.3グラム、脂質は8.8グラム、炭水化物は2.8グラム、コレステロールは585ミリグラム、ビタミンAは234マイクログラム、ビタミンEは1.84ミリグラム、カリウムは154ミリグラム、カルシウムは56ミリグラムである。 ただし、スクランブルエッグは油と塩を加えて調理するため、卵が油を吸収してカロリーが少し高くなる。 そのため、高血圧や高脂血症の人が卵を食べるときは、ゆで卵や蒸し卵にするのがベストである。スクランブルエッグにする場合は、飽和脂肪酸の摂取を減らすため、油を少なめにするか、不飽和脂肪酸の多い油（大豆油などの植物油）を使うようにしよう。 卵アレルギーの人は、スクランブルエッグの摂取を禁止されている。