ヨモギの効能は、温経止痛（身体の経絡を温めて体内の出血を止めること）、散寒止痛（体内の寒気を散らして痛みを和らげること）、外用では散湿止痒（湿を散らしてかゆみを和らげること）である。 主に虚寒出血、月経不順、皮膚のかゆみの治療に用いられる。
よもぎは「愛艾」とも呼ばれ、『名医別録』に初めて収載された。 この製品の性質は温性で、温は冷えを分散させることができ、重要な薬の出血を停止するために暖かい月経のため。 本剤は主に肝、脾、腎経に入り、下元虚寒、重建不固（重建2脈が弱く、重建機能に影響する）、漏経（月経血や経血より滴下する）、月経痛などに用いる。
ヨモギは辛味と温性があり、冷えによる痛みを和らげ、子宮を温めて妊娠を助け、月経不順、月経困難症、子宮冷え性不妊症に用いることができる。 よもぎはまた、湿気の除去、殺虫、かゆみの緩和のために外用することもでき、湿疹、陰部のただれなどに用いられる。
よもぎの副作用は明確ではない。 よもぎは、イライラや不眠、寝汗（寝ると異常に汗をかき、起きると汗が止まる）など、陰虚血熱のある人には注意が必要である。 よもぎは毒性が少ない。 投薬が必要な場合は、やみくもに自己判断で投薬するのではなく、医師の指導のもとで使用する。