1.核酸抗原に対する自己抗体（ANA)
ANAは.全身性エリテマトーデス.強皮症.ドライ症候群.関節リウマチなど多くのリウマチ性疾患で陽性となることがあり.びまん性結合組織病の診断のためのスクリーニング抗体として用いられています。健康な高齢者.感染症.特定の薬剤（プロカインアミド.ヒドラジンピリダジン.フェニトインナトリウム.イソニアジドなど）服用中の患者は.ANAが陽性となることがあります。
2.抗DNA抗体
抗二本鎖DNA（dsDNA）抗体はSLEの診断に高い特異性を持っています。特に血清中の抗dsDNA抗体価が高い活動性のSLEの患者では.その特異性が高くなります。また.多くの疾患や健常者でも低力価の抗dsDNA抗体を認めることがあります。
3. 抗ENA（抽出可能核抗原）抗体
(1)抗nRNP（核内RNP）。抗u1RNP抗体は.混合結合組織病ではほとんど陽性で.その力価も高く.その他の結合組織病では.陽性率は低く.力価も低く.結合組織病と非結合組織病とを区別する強力な指標となる。抗u1RNP抗体が陽性の患者さんでは.手のむくみ.レイノー現象.筋炎.指（足指）端の硬化などがしばしばみられます。抗u1RNP抗体陽性のSLE患者は.抗dsDNA抗体が陰性であれば腎症の発症率は低く.抗dsDNA抗体と抗Sm抗体が存在すればループス腎炎の可能性が高いと考えられています。
(2) 抗Sm抗体：SLEではその陽性率は約30％です。抗Sm抗体は.初期の非定型SLEや治療後寛解したSLEの後方診断に非常に有用です。
(3)抗SSA/RO抗体。ドライ症候群（シェーグレン症候群）に関連するため.SSAと命名されました。
(4) 抗SSB/La, Ha抗体：ドライ症候群に関連するもう一つの抗体で.SSBと呼ばれています。
(5)抗rRNP抗体。rRNP抗体のみが陽性でANAが陰性の患者さんでは.経過観察が必要で.数年後に典型的なSLEに発展する可能性があります。
(6) 抗Scl-70抗体。抗Scl-70抗体陽性のSD患者は.抗Scl-70抗体陰性のSD患者に比べ.間質性肺変性症の発症リスクが10倍以上高くなります。抗Scl-70抗体は.心臓や腎臓の病変とは関連性がないようです。
(7) 抗Jo-1抗体。肺間質変性症を合併したPM/DM患者では.抗Jo-1抗体が60％と高率であるrdquo;。抗Jo-1抗体は.PM/DMのマーカー抗体とされることが多い。
4.リウマトイド因子(RF)
自己免疫疾患：ドライ症候群.SLE.PSS.PM/DMなど.感染症：細菌性心内膜炎.結核.ハンセン病.感染性肝炎.住血吸虫症など.非感染症：びまん性間質性肺線維症.肝硬変.遅効性肝臓.結節疾患.マクログロブリン血症などその他多くの疾患で出現する。
5.抗ケラチン抗体(AKA)
RA の早期診断.予後の指標の一つです。患者の滑液中のこの抗体の陽性率は基本的に血清と同じですが.その程度は後者より有意に高いことから.AKAは滑液中で局所的に合成され.滑膜炎の形成に重要な役割を果たしている可能性が示唆されます。
6.抗環状シトルリン化ペプチド(CCP)抗体
抗CCP抗体陽性のRA疾患は重篤で.骨破壊が明らかである。
7.抗リン脂質抗体（抗リン脂質抗体.APL)
抗リン脂質抗体（APL）は.主に抗リン脂質症候群（APS）に関連する抗体です。これには.抗カルジオリピン抗体（ACL）.ループスアンチコアグラント（LAC）.抗ホスファチジルセリン.抗ホスファチジルグリセロール.抗ホスファチジン酸.抗&β;2 –glycoprotein 1 (β2 – GP1)など.様々な抗体がある。これらの抗体は.抗リン脂質症候群（APS）.SLE.神経疾患.急性・慢性白血病.腎臓・消化器疾患などでよく見られ.これらの疾患における凝固系の変化.血栓症.血小板減少などと密接に関連し.疾患発症のメカニズムに関係していると言われています。現在.臨床の現場で日常的に検出される抗リン脂質抗体は.抗カルジオリピン抗体とループスアンチコアグラントのみです。
8.PR3-ANCA
C-ANCAによるWG診断の特異度は90％以上.PR3-ANCAは95％以上である。感度は疾患活動性と病期に依存し.初発の不活性型WGでは50％しか陽性にならず.典型的な活動性を有するWGではほぼ100％陽性である。PR3-ANCAは.顕微鏡的多発血管炎（MPA）.壊死性半月体型糸球体腎炎（NCGN）.結節性多発動脈炎（PAN）など他の原発性血管炎でも検出される。 PR3-ANCA のもう一つの重要な臨床応用例 PR3-ANCA のもう一つの重要な臨床応用例として.抗体価は疾患活動性と一致し.WG などの原発性血管炎患者の効果判定や再発予測の指標としてしばしば用いられ.臨床治療の指針となっていることが挙げられます。
9.MPO-ANCA
MPO-ANCAは.主にMPA.NCGN.Churg-Strauss症候群と関連しています。MPO-ANCAは.PAN.抗糸球体基底膜疾患（抗GBM疾患）.WG.SLE.RA.薬物性ループス.フェルティ症候群など.他の疾患でも見られる。MPO-ANCAはSLEの約10％～15％に認められます。MPO-ANCAはRAにおける関節外障害や血管障害にも関連しています。MPO-ANCA は疾患活動性と相関しており.有効性の判断.再発の推定.治療の指針として利用することも可能です。