肝膿瘍は回復後、普通の人と同じ余命を持つことができ、余命には影響しない。
肝膿瘍の原因は細菌感染やアメーバ感染によるもので、手術、投薬、穿刺、ドレナージなどの積極的な治療を行えば、ほとんどが治癒し、予後も良好で、通常は後遺症もなく、生命予後に大きな影響を与えることはありません。
肝膿瘍が回復したら、定期的な経過観察が重要で、その期間は肝膿瘍の大きさによって異なります。 注意すべき主な指標は、症状や体温、白血球数、血清C反応性蛋白（CRP）やプロカルシトニン（PCT）などの炎症指標の値などである。
生活面では、栄養を補い、労作や寒さを避けることに注意を払う必要がある。 また、糖尿病患者は積極的に血糖をコントロールすべきである。
予兆や症状に注意し、発熱や肝臓の痛みがある場合は早めに病院へ行くこと。