通常、口内炎の腫れをすぐに取り除く方法はなく、患者は一般治療、薬物治療、理学療法などの方法で症状を緩和することができる。
1.一般治療：口腔衛生を保ち、二次感染を防ぎ、軽い食事に注意し、辛いものや刺激の強いものを避け、病中病後は禁煙、禁酒し、外傷の刺激を悪化させないようにし、腫れをひどくさせないようにする。
2.薬物療法：リドカインなどの外用鎮痛剤、クロルヘキシジンうがい薬、0.1％イサクリジンなどのうがい薬、遺伝子組換えヒト上皮成長因子ゲルなどの治療薬を使用し、局所的に症状を緩和する。
3.理学療法：潰瘍にレーザー、可視光線、マイクロ波などを照射して滲出液を減少させ、治癒を促進することもできる。
医師の処方した薬を厳守し、薬の量を変えたり、薬を乱用したりせず、生活の中で口腔ケアに注意し、定期的に見直すことをお勧めします。