一般にうつ病性障害には明らかな器質的病変はなく、血液検査でうつ病を診断することはできないが、脳の器質的疾患、身体疾患、ある種の薬物や精神作用物質による二次的な気分障害を除外するなど、他の疾患を除外する役割を果たすことができる。 1.脳の器質的疾患：例えば、頭蓋内変性疾患、脳血管障害、頭蓋内感染症、外傷性脳損傷、脳腫瘍、てんかんなど。 アルツハイマー病などでは、生化学検査、甲状腺機能測定、ビタミンB12と葉酸検査、全血球計算、血清梅毒抗体検査などを定期的に行う必要がある。 2.身体疾患：身体感染症、内臓疾患、内分泌疾患。 例えば、副甲状腺機能異常の良性副甲状腺腺腫は、高カルシウム血症と精神症状を引き起こす。 3.特定の薬物や精神作用物質：バルビツール酸塩、アルコール、アンフェタミン、コカイン、ケタミン、オピオイド、タバコなどの精神障害が原因で、臨床検査で対応する指標が変化する。 うつ病の患者には、標準的な診断と治療を受けるために家族の同伴が推奨される。