上咽頭CTで上咽頭がんを除外することはできない。 上咽頭がんは.上咽頭側壁の咽頭陰窩に発生する悪性腫瘍で.ほとんどが扁平上皮がんであり.臨床診断のゴールドスタンダードは生検の病理結果である。 典型的な上咽頭がんでは.再発性の逆流性血性粘液.耳鳴り.頭痛.鼻づまりなどの症状がみられるが.これは実際には腫瘍がある程度の大きさまで発育して初めて現れるものである。 この場合.上咽頭CT検査を行えば.上咽頭に軟部組織病変が存在することや.病変の具体的な範囲を知ることはできるが.上咽頭癌かどうかを診断することはできない。 上咽頭癌の初期であっても.典型的な臨床症状はまだ十分に現れておらず.上咽頭のCTスキャンでは異常所見が全くないことさえある。 したがって.上咽頭癌の診断は.現在でも経鼻内視鏡検査と局所生検病理検査によって行われる。