一般的な臨床用語である肝門部は第一肝門部を指すべきであり、第一肝門部から出入りしない構造は肝静脈である。 第一門脈のほかに、第二門脈と第三門脈がある。 1.第一門脈：肝臓の内臓表面で、さまざまな管や神経が出入りする場所を指す。 肝動脈、門脈、肝管、肝神経、肝リンパなどが含まれる。 主に肝臓に血液を供給し、消化管から吸収された栄養素を肝臓に輸送して前処理を行い、胆汁分泌物を胆嚢と総胆管に排出する。 2.第二肝門部：肝臓の後方で肝静脈が肝臓から離れる部分を指す。 主な機能は、肝臓からの血流を下大静脈に流し、最終的に心臓に戻すことである。 3.第三肝門部：肝静脈を通らず、直接下大静脈に入る肝臓の小静脈や短い血管を指します。 これらの静脈や血管は小さく数も多いため、手術中に注意を怠ると容易に出血を起こす。