精巣上体結核は自然治癒は不可能で、積極的な治療が必要で、一般的に用いられる方法には、リファンピシンなどの薬物治療と精巣上体摘出、睾丸摘出などの外科治療がある。
1.薬物治療：初期の精巣上体結核は主に薬物で治療され、大部分は治すことができます。 早期、定期的、全コース、全投与量、併用が必要で、よく使われる第一選択の抗結核薬にはリファンピシン、ピラジナミド、エタンブトールなどがあります。
2.手術：薬物治療の効果が思わしくなく、病変が重く、陰嚢皮膚洞路や膿瘍形成がある場合は、薬物治療の協力のもと、精巣上体摘出術や睾丸摘出術を行う必要があり、精巣上体と精巣をできるだけ温存し、周術期の安全性に注意する必要がある。
精巣上体結核と診断された場合は、早期に標準的な治療を行い、副作用を軽減することが推奨される。