喉頭蓋嚢胞は通常、術後約21日間は腫れがない。
喉頭蓋嚢胞の手術は、主に嚢胞壁の上蓋を切除した後、その基底部の嚢胞壁をレーザーや電気メスで破壊して治療するか、再発性の嚢胞や大きな嚢胞に対しては、嚢胞壁を完全に切除する舌側メコ咽頭切開術が行われる。 手術はしばしば周囲の緩い組織に不快感や刺激を与え、術後には手術部位にさまざまな程度の浮腫が生じる傾向がある。
術後の外傷修復過程は通常、創傷治癒に約1週間、粘膜の競合的成長に約1週間、浮腫軽減に約1週間を要する。 粘膜上皮の初期回復は約3週間で完了し、完全に正常な状態に戻るには約1ヵ月、浮腫期間の終了には約21日を要することが多い。
喉頭蓋嚢胞の回復期には半流動食が必要で、巨大嚢胞の場合は手術範囲が広く、外傷が深いため、流動食が必要である。一方、中咽頭腔を清潔に保ち、辛い刺激や硬い食べ物の摂取を避け、術後の出血や感染症などの副作用の発生を抑え、回復期を遅らせたり、組織の修復に影響を与えないようにする。