重度の水腎症はより深刻で、腎実質が著しく損傷され萎縮して腎性高血圧症を引き起こしたり、重篤な感染症を合併したりする。 水腎症は、腎盂からの尿の排出障害、腎内圧の上昇の蓄積、腎盂および穎果の拡張、腎実質の萎縮、および機能喪失を指す。 尿路閉塞は、病因、閉塞部位、程度および期間によって異なる臨床症状を示すことがある。 腎実質の著しい破壊、萎縮を伴う重症の水腎症で、腎高血圧症を引き起こしたり、重症の感染症を合併したり、対側は正常な腎機能を有しているにもかかわらず、腎機能が著しく低下している場合は、片側の腎臓を摘出した後、対側を確実に補う必要があるため、患側の腎臓を切除することがある。 同じ疾患であっても、患者の身体状況や病期の違いにより治療方法は異なるので、医師の指導のもと標準化する必要がある。