鼻炎と角膜炎が同時に起こった場合、鼻炎と角膜炎を別々に治療する必要があり、薬物治療が必要である。
1.鼻炎：生理食塩水で鼻腔を洗浄することで炎症症状を改善することができ、ブデソニド、モメタゾンフロエートなどの局所点鼻薬を治療に使用することができます。 アレルギーが原因の場合は、セチリジン、ロラタジンなどが治療に用いられます。 萎縮性鼻炎には、栄養を強化するビタミン剤、粘膜の血管拡張を促進するネオスチグミンの鼻腔内塗布などが用いられる。
2.角膜炎
(1)細菌性：エリスロマイシン軟膏、ゲンタマイシン軟膏を局所に使用できるが、コントロールできず角膜穿孔に至った場合は、セフラジン、トブラマイシンなどの内服や全身治療も必要である。
(2)真菌：ミコナゾール点眼液、フルシトシン点眼液の外用が可能であり、重症例ではフルコナゾール、ミコナゾールの内服や静注も必要である。
(3）単純性サイトメガロウイルス：ガンシクロビル、アシクロビルの外用、再発例ではアシクロビル、ガンシクロビルの内服、デキサメタゾン、プレドニゾロンなどのグルココルチコイド薬の併用が必要。
(4)黄色ブドウ球菌：ゲンタマイシン、カナマイシンなどの抗生物質が使用され、通常、病勢は長期にわたるため、なお徹底した治療が必要である。
すべての薬剤の使用には厳格な適応があり、有害な結果を引き起こさないように、許可なく使用してはならない。