逆流性食道炎は再発しやすいため、一般的な治療や薬物療法だけでなく、その治療に基づいて逆流性食道炎発症の危険因子を回避することが必要であり、これによって治癒を根絶することができる。
逆流性食道炎と診断された患者は、就寝前の食事を避け、ベッドの頭を高くして眠り、チョコレート、コーヒー、濃いお茶など下部食道括約筋を弛緩させる食品を避ける必要がある。 また、医師の指示に従い、オメプラゾールなどの酸抑制剤、モサプリドなどの胃力剤、チオ硫酸アルミニウム、炭酸アルミニウムマグネシウムなどの胃粘膜保護剤を使用する必要がある。
標準的な治療を行えば、逆流性食道炎は治癒するが、再発しやすいので、肥満や腹水など腹腔内圧を上昇させる要因を避け、喫煙や飲酒などを避けるなど、逆流性食道炎を引き起こすハイリスク因子を避けることも重要である。
逆流性食道炎と診断された患者さんは積極的に医師の治療に協力し、必要であればラップ形成などの外科的治療も可能である。