ハトムギには、気を補い陽気を促進する作用、滞りや麻痺を移動させる作用（麻痺した経絡をスムーズにする）、表面を固めて発汗を止める作用（筋肉の表面を固めて発汗を止める）、保水作用を促進し腫れを抑える作用、ただれを収束させて筋肉を生成する作用（ただれを早く治し、新しい肉の成長を促進する）、毒素排出作用（体内の膿や毒素を排出する）などがある。 しかし、水の役割は限られており、薬の治療的役割に取って代わることはできない。
ハトムギは甘く、やや温性で、脾肺経に属し、補気作用があり、脾気虚による疲労感や虚弱感、少食、緩便（便が細く、形が整っていない）を改善する。 陽気を高める作用があるため、特に長引く下痢による内臓脱や脱肛、中気が沈むことによる肛門脱（脾胃気虚で内臓が下に落ちる様子など）によい。
ハトムギは気を補って気・血・津液の運行を促進し、気虚による浮腫を改善する。 自然発汗（日中に不随意に発汗し、発汗のわずかな動きで悪化する）、肺虚による咳や喘鳴も同様である。
気滞を去り、痺を去り、爛を去り、筋を恢復し、毒素を補い、膿を除くには、本剤は気を補い痺を去り、気を補い血を補う。 この薬はよく脳卒中の後遺症や気虚血滞による麻痺、腱や皮膚の栄養不足の治療に使われます。
また、本剤は陽気を旺盛にし、邪気を押し出す作用があり、癰や壊疽（体表、四肢、内臓に発生する毒瘡、急性化膿性疾患の一種）で、潰瘍が長いが収斂していないもの、あるいは腐敗しにくく潰瘍化しにくいものの治療に用いることができる。
ハトムギは伝統的な漢方薬であり、疾病の応用治療であるため、医師の指導のもとで使用する必要があり、やみくもに服用してはならない。 もし不快な症状があれば、適時に医師の治療を受けるべきである。