黄連清胃丸の効能は、胃をすっきりさせ、下痢を改善するほか、歯茎の腫れや痛み、舌や口のただれ、胃熱による歯痛、火眼（伝染性結膜炎、別名赤目）の発生などに治療効果があり、医師の処方に従って治療する必要がある。
黄連清熱丸は黄連、ルバーブ、アスパラガス、石膏、大黄、薄荷、玄参、オウゴン、知母、山梔子、茴香、甘草、亜硝酸マンガンなどを配合した独自の漢方薬で、健胃、利咽の作用があり、歯茎の腫れや痛み、口や舌のただれ、胃熱や歯痛、火眼発生などの症状に適している。
アレルギー体質の人や妊婦には禁忌で、小児、高齢者、虚弱者、脾胃虚寒の人には慎重に使用する。 治療中は喫煙、アルコール、スパイシーで脂っこい食べ物は避けるべきである。 副作用は今のところ明らかではないが、服用後、便の回数が1日2～3回の場合は適宜減量し、3回以上の場合は服用を中止し、医師に相談すること。
具体的な投薬は専門医の指導のもとで行うべきであり、無許可での使用は禁物である。