肺肺胞合併気腫は、病気の寛解期に肺機能運動で強化し、急性期には薬物療法を行い、必要に応じて手術を行う必要がある。
1.寛解期：肺気腫肺胞合併症状がない場合、寛解期に肺機能運動を率先して行い、呼吸筋群の筋力と持久力を強化し、在宅酸素療法を行う。 病気の増悪を防ぐために、煙や大気汚染から離れた快適な環境で行うべきである。
2.急性期：急性期には、セフロキシム、クリンダマイシンなどの抗菌薬を医師の処方に従って使用する。 気管支痙攣が起こった場合は、アミノフィリンなどの気管支鎮痙薬を処方する。 必要であれば、デキサメタゾンなどのホルモン剤で炎症を抑える。
3.外科的治療：肺水疱の巨大化、肺組織の圧迫、血胸、気胸などによる破裂、肺感染症などを繰り返す場合は、通常の病院で外科的治療を行いますが、一般的には胸腔鏡下肺楔状切除術を選択することができます。